Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmp1Q99KU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmp1Q99KU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms