Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2aQ99KJ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2aQ99KJ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms