Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp11Q99K46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp11Q99K46 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms