Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b3Q921M3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b3Q921M3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b3Q921M3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms