Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn4Q8VCH8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn4Q8VCH8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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