Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H0

Appl1, DCC-interacting protein 13-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl1Q8K3H0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Appl1Q8K3H0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Appl1Q8K3H0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Appl1Q8K3H0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Appl1Q8K3H0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms