Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Champ1Q8K327 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Champ1Q8K327 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Champ1Q8K327 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Champ1Q8K327 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Champ1Q8K327 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Champ1Q8K327 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms