Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neil3Q8K203 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil3Q8K203 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil3Q8K203 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms