Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl1Q8CEQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl1Q8CEQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms