Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc87Q8CDL9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms