Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms