Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf31Q8CCF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf31Q8CCF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf31Q8CCF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms