Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms