Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Iffo1Q8BXL9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Iffo1Q8BXL9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Iffo1Q8BXL9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Iffo1Q8BXL9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms