Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx1bQ8BX32 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx1bQ8BX32 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx1bQ8BX32 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx1bQ8BX32 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slx1bQ8BX32 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms