Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pbrm1Q8BSQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pbrm1Q8BSQ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms