Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abraxas1Q8BPZ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abraxas1Q8BPZ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms