Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snapc4Q8BP86 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snapc4Q8BP86 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Snapc4Q8BP86 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snapc4Q8BP86 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snapc4Q8BP86 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc4Q8BP86 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms