Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK03

Miga2, Mitoguardin 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga2Q8BK03 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Miga2Q8BK03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Miga2Q8BK03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Miga2Q8BK03 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Miga2Q8BK03 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Miga2Q8BK03 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms