Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2af1l4Q8BGJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms