Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc38a9Q8BGD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc38a9Q8BGD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms