Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sv2bQ8BG39 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sv2bQ8BG39 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sv2bQ8BG39 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms