Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NanogQ80Z64 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NanogQ80Z64 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NanogQ80Z64 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NanogQ80Z64 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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