Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcsk9Q80W65 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcsk9Q80W65 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms