Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc1Q80VQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lrrc1Q80VQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms