Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sestd1Q80UK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sestd1Q80UK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms