Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Avl9Q80U56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Avl9Q80U56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Avl9Q80U56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Avl9Q80U56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms