Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lca5Q80ST9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lca5Q80ST9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms