Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp6r1Q7TSI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp6r1Q7TSI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp6r1Q7TSI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ppp6r1Q7TSI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms