Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnf1Q7TSH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnf1Q7TSH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms