Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf1Q7TND5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpf1Q7TND5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms