Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubfd1Q78JW9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubfd1Q78JW9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubfd1Q78JW9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubfd1Q78JW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms