Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Syne2Q6ZWQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms