Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LcorQ6ZPI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LcorQ6ZPI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms