Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c54Q6XVG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c54Q6XVG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp2c54Q6XVG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2c54Q6XVG2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms