Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54bQ6PFE3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad54bQ6PFE3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad54bQ6PFE3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms