Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc117Q6PB51 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc117Q6PB51 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.5 ms