Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp140Q6NSQ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp140Q6NSQ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp140Q6NSQ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms