Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc66Q6NS45 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc66Q6NS45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc66Q6NS45 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms