Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt77Q6IFZ6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt77Q6IFZ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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