Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd2Q6DVA0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd2Q6DVA0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms