Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prex1Q69ZK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prex1Q69ZK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prex1Q69ZK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prex1Q69ZK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Prex1Q69ZK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Prex1Q69ZK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Prex1Q69ZK0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prex1Q69ZK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms