Protein–RNA interactions for Protein: Q64442

Sord, Sorbitol dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SordQ64442 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SordQ64442 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SordQ64442 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SordQ64442 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SordQ64442 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SordQ64442 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SordQ64442 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SordQ64442 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SordQ64442 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SordQ64442 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SordQ64442 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SordQ64442 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SordQ64442 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SordQ64442 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SordQ64442 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SordQ64442 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SordQ64442 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SordQ64442 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SordQ64442 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SordQ64442 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SordQ64442 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SordQ64442 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SordQ64442 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SordQ64442 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SordQ64442 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SordQ64442 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SordQ64442 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SordQ64442 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SordQ64442 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SordQ64442 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SordQ64442 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SordQ64442 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SordQ64442 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SordQ64442 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SordQ64442 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SordQ64442 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SordQ64442 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SordQ64442 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SordQ64442 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SordQ64442 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SordQ64442 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SordQ64442 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SordQ64442 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SordQ64442 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SordQ64442 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SordQ64442 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SordQ64442 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SordQ64442 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SordQ64442 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SordQ64442 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SordQ64442 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SordQ64442 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SordQ64442 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SordQ64442 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms