Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Zeb1Q64318 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Zeb1Q64318 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Zeb1Q64318 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Zeb1Q64318 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Zeb1Q64318 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms