Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf4Q64287 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf4Q64287 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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