Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CochQ62507 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CochQ62507 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CochQ62507 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CochQ62507 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CochQ62507 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CochQ62507 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CochQ62507 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CochQ62507 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CochQ62507 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CochQ62507 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CochQ62507 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CochQ62507 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CochQ62507 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CochQ62507 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CochQ62507 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CochQ62507 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CochQ62507 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CochQ62507 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CochQ62507 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CochQ62507 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CochQ62507 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CochQ62507 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CochQ62507 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CochQ62507 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CochQ62507 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CochQ62507 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CochQ62507 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CochQ62507 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CochQ62507 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CochQ62507 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CochQ62507 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CochQ62507 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CochQ62507 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CochQ62507 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CochQ62507 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CochQ62507 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CochQ62507 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CochQ62507 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CochQ62507 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CochQ62507 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CochQ62507 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CochQ62507 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CochQ62507 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CochQ62507 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CochQ62507 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CochQ62507 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CochQ62507 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CochQ62507 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CochQ62507 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CochQ62507 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CochQ62507 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CochQ62507 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CochQ62507 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CochQ62507 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CochQ62507 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CochQ62507 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CochQ62507 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CochQ62507 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CochQ62507 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CochQ62507 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CochQ62507 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CochQ62507 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CochQ62507 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CochQ62507 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CochQ62507 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CochQ62507 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CochQ62507 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CochQ62507 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CochQ62507 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CochQ62507 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CochQ62507 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CochQ62507 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CochQ62507 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CochQ62507 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CochQ62507 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CochQ62507 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CochQ62507 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CochQ62507 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CochQ62507 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CochQ62507 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CochQ62507 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CochQ62507 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CochQ62507 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms