Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp1Q62442 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp1Q62442 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms