Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpaQ62189 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms