Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mrc1Q61830 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mrc1Q61830 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mrc1Q61830 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mrc1Q61830 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mrc1Q61830 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mrc1Q61830 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mrc1Q61830 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mrc1Q61830 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mrc1Q61830 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms