Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LbpQ61805 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LbpQ61805 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LbpQ61805 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LbpQ61805 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LbpQ61805 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LbpQ61805 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LbpQ61805 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LbpQ61805 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbpQ61805 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbpQ61805 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LbpQ61805 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LbpQ61805 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbpQ61805 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbpQ61805 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.2 ms